1. Wywołuje ogólnoustrojową reakcję zapalną, co może prowadzić do chorób sercowo-naczyniowych, stłuszczenia wątroby, insulinooporności, innych zaburzeń metabolicznych lub nasilić już istniejące.
2. Miejscowe działanie zapalne na błony śluzowe przewodu pokarmowego (wzdęcia, bóle itp.).
3. Działa jak opiat (beta-kazomorfin może wiązać się z tymi samymi receptorami, co ciężkie narkotyki), co powoduje uzależnienie, a jego działanie nasenne poprzez receptory opioidowe spowalnia perystaltykę jelit.
4. Sprzyja wydzielaniu histaminy, nasilając lub wywołując reakcje alergiczne (dlatego produkty mleczne są surowo przeciwwskazane dla osób z zaburzeniami odpowiedzi immunologicznej).
5. Ale nie chodzi tylko o dorosłych. Obecnie prowadzone są również szeroko zakrojone badania mające na celu ustalenie związku między spożywaniem mleka A1 a opóźnieniem rozwoju psychomotorycznego, autyzmem i cukrzycą typu 1 u dzieci.